La Fondation Pathfinder pour l'éducation et le développement et la Fondation pour l'innovation politique ont oeuvré ensemble pour le lancement de l'UNFM, en réponse à une demande africaine. L'université numérique francophone mondiale a su s'entourer dès son lancement des meilleurs partenaires techniques et académiques. Le Centre national d'études spatiales (CNES), Alcatel Alenia Space, et l'Hôpital européen Georges Pompidou (HEGP) ont permis, dès la phase pilote de l'UNFM, de mettre en place une architecture technique efficace, qui comprend les technologies de transmission et les sites d'émission et de réception.

En 2006, le Fonds de solidarité numérique est devenu un partenaire important de l'UNFM : il devrait procéder à l'équipement informatique des centres UNFM de Brazzaville, au Congo, de Niamey au Niger et de Antananarivo à Madagascar. L'Université numérique francophone mondiale s'est aussi entourée de partenaires académiques prestigieux, pour offrir à ses étudiants une excellente qualité d'enseignement, prodigué par les plus grands spécialistes. Dans l'enseignement de la santé, considéré comme prioritaire pour l'UNFM, le conseil scientifique de l'UNFM, présidé par le Professeur Michel Le Bras, spécialiste de médecine tropicale, a fait appel aux meilleurs enseignants en la matière, afin d'offrir les meilleurs cours, et surtout les mieux adaptés aux étudiants bénéficiaires et au milieu dans lequel ils travaillent.